Prakarsa pendirian STKIP Muhammadiyah Sorong muncul ketika Pimpinan Daerah Muhammadiyah Kabupaten Sorong Periode 2000–2005 mengadakan Rapat Kerja Daerah (RAKERDA) Majelis Pendidikan Dasar dan Menengah. Kegiatan tersebut berlangsung di Madrasah Aliyah Muhammadiyah Aimas pada 13 November 2001.
Melalui RAKERDA tersebut, ditetapkan salah satu program kerja penting, yaitu pendirian STKIP Muhammadiyah Sorong pada tahun 2003. Keputusan ini lahir dari kebutuhan akan lembaga pendidikan tinggi di bidang kependidikan di wilayah Sorong, yang saat itu belum tersedia. Selain itu, kehadiran Persyarikatan Muhammadiyah di Sorong mendorong peran aktif dalam mencerdaskan kehidupan bangsa, sebagai wujud tanggung jawab bersama dan bukan semata-mata tugas pemerintah.
Sebagai langkah awal proses pendirian, dibentuklah sebuah panitia yang terdiri dari:

Ketua      : Drs. Rustamadji
Sekretaris : Manut Pratikno, BA
Anggota   : Sulardi, S.Pd., Suwarto, S.Sos., Sutikno, Ir. Eko Tavip Maryanto, Muhadi, Supirman, S.Sos.

Pada tahun 2003, terbit SK PP Muhammadiyah Nomor 78/KEP/I.0/D/2003 tanggal 20 September 2003 yang menetapkan Drs. Rustamadji sebagai Ketua pertama STKIP Muhammadiyah Sorong. Beliau sebelumnya telah mengundurkan diri dari jabatan Ketua Pimpinan Daerah Muhammadiyah Kabupaten Sorong.
Pada saat yang sama, Majelis Diktilitbang PP Muhammadiyah juga menerbitkan SK Pengangkatan Pengurus Badan Pelaksana Harian (BPH) STKIP Muhammadiyah Sorong dengan susunan pengurus yang diketuai oleh Drs. Suwarto Abbas, M.H. Namun, karena beliau pindah tugas, pada tahun 2004 Majelis Diktilitbang kembali menetapkan Pengurus BPH Pengganti Antar Waktu yang diketuai oleh Drs. Nursono Sidiq.
Pada tahun yang sama, kunjungan tim PP Muhammadiyah ke Kabupaten Sorong yang dipimpin oleh Prof. H. Zamroni, Ph.D., membawa kabar baik bahwa Menteri Pendidikan Nasional RI, Prof. Drs. H.A. Malik Fadjar, M.Sc., telah menyetujui pendirian STKIP Muhammadiyah Sorong. Dengan persetujuan tersebut, kampus dapat segera membuka penerimaan mahasiswa baru.
Syukur Alhamdulillah, pada 19 Agustus 2004 terbit SK MENDIKNAS RI Nomor 127/D/O/2004 tentang Pemberian Izin Penyelenggaraan Program-Program Studi dan pendirian STKIP Muhammadiyah Sorong. Adapun program studi yang mendapatkan izin penyelenggaraan meliputi:

1. Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia jenjang program Sarjana (S1)
2. Pendidikan Bahasa Inggris jenjang program Sarjana (S1)
3. Pendidikan Biologi jenjang program Sarjana (S1)

 

PENDIRIAN PERGURUAN TINGGI :

Pendirian                                                         : Tanggal 19 Agustus 2004

Ijin Pendirian oleh                                            : Depdiknas

No. Izin Pendirian                                            : 127/D/O/2004

Tanggal Milad/Dies Natalis                              : 19 Agustus

Pelaksanaan Wisuda                                      : 1 kali dalam setahun

Tanggal & Bulan Pelaksanaan Wisuda           : 8 September